L'Università di Bologna è tra gli 8 atenei italiani ammessi alla sperimentazione del Progetto S.I.O.P.E., Sistema Informativo delle Operazioni degli Enti Pubblici, avviato dal Ministero dell'Economia e delle Finanze. Il Ministero dell'Economia e delle Finanze, infatti, in data 29 settembre ha deciso l'avvio della sperimentazione del S.I.O.P.E. a partire dal 1 ottobre 2005.
La sperimentazione, che impone la codifica gestionale di tutte le operazioni di incasso e di pagamento con criteri uniformi per tutte le amministrazioni pubbliche su tutto il territorio nazionale, è prevista dalla Legge Finanziaria 2005. Alla prima fase della sperimentazione partecipano 2 regioni, 4 province, 11 comuni, 3 comunità montane e 8 università.
La sperimentazione del S.I.O.P.E. è legata alla sperimentazione del superamento del Sistema di Tesoreria Unica degli enti pubblici.